代谢组学测序样本及样本量要求

在生命科学研究的广阔领域中，代谢组学作为一门新兴且充满活力的学科，正逐渐崭露头角。它通过对生物体内代谢物的全面分析，揭示了生物体在不同生理状态、疾病进程以及环境因素作用下的代谢变化。然而，要想准确捕捉这些代谢变化，代谢组学测序的样本及样本量要求就显得尤为重要。

代谢组学测序样本

一、样本类型
代谢组学研究的样本类型多种多样，常见的包括：
1、动物或临床样本：如血清、血浆、尿液、唾液、脑脊液、关节液、淋巴液、组织（如肝、肾、肌肉、肿瘤等）、细胞及其培养基等。
2、植物样本：如叶片、茎、花、根、果实等。
3、微生物样本：如细菌、真菌及其发酵液等。

二、样本收集与保存
不同类型的样本在收集与保存时需注意以下要点：
1、血液样本（血清、血浆）：
从合适的静脉采集血液，通常采集量为10mL左右。
使用肝素锂抗凝管（用于血浆）或普通血清管进行收集。
离心分离出血清或血浆，并分等份（如0.5mL或0.1mL）转移到冻存管中。
保存于-80℃冰箱，寄送时需使用足量干冰。
2、尿液样本：
收集晨起中段尿（临床）或晨间1小时尿（动物）。
直接分装到离心管中，每管1mL左右。
添加叠氮化钠作为防腐剂，并尽快进行离心处理。
保存于-80℃冰箱，寄送时需使用足量干冰。
3、组织样本：
从动物或人体上取下组织后，先用生理盐水冲洗干净。
用干净的无尘吸水纸吸干水分，然后分等份（如20mg/管）装入标记好的离心管中。
迅速放入液氮中冷冻处理至少15分钟，然后保存于-80℃冰箱。
4、细胞样本：
对于悬浮细胞，连同培养基转移到离心管中，低速离心使细胞沉淀。
倒掉培养基后，用PBS清洗一次，再次离心后倒掉PBS。
将离心管的尖端插入液氮中淬灭细胞，然后保存于-80℃冰箱。
对于贴壁细胞，先倒掉培养基，用PBS清洗一次后，将培养皿底部接触液氮淬灭细胞。
加入甲醇-水溶液将细胞刮下并转移到离心管中，然后保存于-80℃冰箱。
5、植物样本：
取整片叶片、一段茎、一朵花或根等部分，迅速用PBS漂洗去掉泥土杂质等。
放入离心管或锡箔纸中并标记，迅速放入液氮中冷冻处理至少15分钟。
取出后迅速放入自封袋中，并注明样本信息。
保存于-80℃冰箱，寄送时需使用足量干冰。
6、微生物样本：
将微生物连同培养基转移到离心管中，低速离心使细菌沉淀。
倒掉培养基后，用PBS清洗一次并离心收集菌体。
将离心管的尖端插入液氮中淬灭细菌，然后保存于-80℃冰箱。

三、样本量要求
代谢组学测序的样本量要求通常根据实验设计和样本类型而定。一般来说：
1、血液样本：至少需要2毫升。
2、尿液样本：推荐量不少于5毫升。
3、组织样本：根据组织类型和实验需求而定，一般不少于50毫克。
4、细胞样本：对于哺乳动物细胞系，通常需要1×10^7个细胞/样本。
5、植物和微生物样本：样本量需根据具体实验需求而定，但通常也需达到一定的数量以确保检测的准确性和重复性。
样本量过少可能会在一定程度上影响检测的准确性和重复性。因此，在收集样本时应尽量多收集并分装冻存，避免反复冻融。同时，在寄送样本时也应使用足量干冰以确保样本在运输过程中的稳定性。

代谢组学测序的成功与否在很大程度上取决于样本的选择和样本量的设计。合理的样本选择能够确保数据的代表性，而合适的样本量能够提高实验的统计功效，帮助研究者更好地发现代谢差异。

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