为什么要用自动化的方式做核酸制备

核酸分离技术是分子生物学的基石，大多数生物实验室应用所需的起始材料都需要通过核酸分离技术获得。然而分离出核酸，实验其实只成功了一半，提纯对于实验结果的准确性和完整性也十分重要，例如：

1、在实验过程中，样品本身、分离样品过程使用的化学品（例如：去污剂、有机溶剂）和工作区域中都有可能存在抑制剂或杂质（例如PCR和逆转录酶抑制剂），如果不对其进行去除，这些因素会直接对下游反应造成干扰，导致实验结果不准确。

2、起始材料的纯度对于NGS样品制备也至关重要。在目标富集、文库构建和大小选择过程中，去除不需要的材料和杂质是确保实验结果准确性的必要操作。

3、从反应混合物和琼脂糖凝胶中提纯所需的PCR扩增子、质粒、限制性消化的DNA片段和RNA是各种生物学研究应用中的先决技术。

如今的分子生物学家的选择范围很广，有一系列易于使用的试剂盒，几乎可以从所有想象得到的任何样品类型中进行核酸分离和纯化。然而虽然有许多试剂盒在纯化核酸方面非常有效，但它们通常是为手动操作而设计的，这存在几个问题：

1、污染风险。

与涉及移液的所有手动工作流程一样，手动纯化存在样本间转移的风险，即使使用多通道移液，有时也无法避免错误，尤其是在多轮处理相对较大的样本数量时可能会出现人工疲劳从而导致误差。

2、难以扩大规模。

工作人员通常在离心机和其他设备中一次性处理的试管数量是有限的。一种常见的解决方法是以较小的批次处理大量样本，但这很慢，并且需要大量的动手操作。因此，手动纯化不是大规模操作的可行选择。

3、容易出错。

除了样品残留风险外，手动方案还存在一定人工失误风险。想象一下这样一个场景，您已经为24个样品管贴上了标签，并且反应已经进行到一半，当您对工作台进行消毒时，如果不小心把标签洗掉，这个小失误可能会毁了整个实验。

4、费时费力。

每次实验时，批量处理样品的需要会占用您很多的宝贵时间，除了做这些基础的工作以外，您还要操作很多类似样本离心的工作，导致大量的时间成本是用于这些重复工作上，实验效率低。如果纯化是您实验室工作流程的常规部分，自动化就可以很好的帮您降低时间和人工成本。

1、简化的提取过程。

使用自动化方案进行准确一致的移液有助于在关键样品处理步骤（如裂解、洗涤和洗脱）中实现均匀性。

2、更少的操作，更少的污染。

更少的手动操作和移液步骤降低了外部污染的威胁和样品携带风险。

3、更大的吞吐量和范围。

通过自动化核酸提取，您可以更快地处理更多样本，从而提高通量。高效率处理可以帮助您扩大研究范围。

4、省时。

自动化为研究人员提供了更多的活动时间，而机器人则负责重复性工作。自动化协议通常也比手动操作更快，从而提升您的实验效率。

5、无缝衔接的工作流程。

在许多情况下，可以将自动化核酸提取方案与预期的下游应用相结合，例如，在自动提取之后即可开始PCR制备和纯化，无缝衔接避免杂质干扰，为您留下一个完美的样品板，为下游应用做好准备。

Opentrons 为您可提供了一套自动化核酸提取解决方案。该方案包括您在实验室中开始自动化 SPRI 微珠清理所需的一切设备，包括：OT-2机器人、磁性模块、单通道和多通道移液器、配套的实验室器具以及我们官网上可免费下载的经过验证的协议。

工作站包含：OT-2移液机器人、PIPETTE GEN2单通道和8通道移液器、磁性模块以及配套的器具和耗材。

Opentrons提供可免费下载使用的实验协议，只需下载该协议加载到您的机器人OT-2上，点击“运行”，就可以让机器人高效完成您的核酸纯化工作。

1、实现全自动清理

2、1.5 小时内可进行 96 次纯化

3、手动准备时间不超过15分钟

OT-2 磁性模块上的特写

“我生命中不知道做过多少次大量重复的制备工作。我不想再做更多类似的无效工作了。”

——Nick Emery，波士顿大学 DAMP

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