高通量 NGS 建库流程中的关键步骤与 Opentrons Flex 支持

在高通量测序应用不断扩展的背景下,NGS 建库流程的稳定性和效率,已经成为影响测序结果质量的重要因素。相比低通量实验,高通量 NGS 建库在样本数量、操作一致性和时间控制方面提出了更高要求。通过自动化平台实现流程标准化,已成为越来越多实验室的选择。围绕高通量 NGS 建库的关键步骤,Opentrons Flex 在多个环节中提供了有效支持。

高通量 NGS 建库流程中的关键步骤与 Opentrons Flex 支持

移液工作站

样本分装与体积控制是高通量基础

高通量 NGS 建库往往从数十到数百个样本同时开始,样本分装的准确性直接影响后续反应体系的稳定性。人工操作在长时间重复移液过程中,容易出现体积偏差或交叉污染。Opentrons Flex 通过高精度移液系统,实现对微量样本的重复、稳定分配,确保每个反应孔的起始条件一致。

在高通量场景下,这种一致性有助于降低样本间差异,为后续建库步骤打下基础。

酶反应步骤对温控与时间要求严格

片段化、末端修复和加 A 等酶反应步骤,对温度和反应时间极为敏感。高通量建库中,如果不同批次或不同孔位存在温控偏差,容易导致文库片段分布不均。Opentrons Flex 通过集成温控模块,在同一平台内完成反应准备与孵育操作,减少样本转移带来的变量。

自动化流程能够精确控制反应时间,避免因人为延迟而影响建库一致性。

接头连接与混匀一致性影响文库质量

在接头连接步骤中,混匀方式和移液精度直接关系到接头连接效率。高通量实验中,人工逐孔混匀难以保持统一标准。Opentrons Flex 可在协议中设定固定的混匀参数,确保每个样本在相同条件下完成接头连接反应。

这种可重复的混匀与移液方式,有助于提高高通量文库的整体均一性。

磁珠纯化是高通量流程中的关键节点

磁珠纯化几乎贯穿整个 NGS 建库流程,是去除杂质和控制片段大小的重要环节。在高通量操作中,磁珠分离和洗涤步骤繁琐,手工操作不仅耗时,也容易出现吸液不彻底或样本损失。Opentrons Flex 配合磁性模块,可自动完成磁珠吸附、洗涤和洗脱流程,减少人为差异。

自动化磁珠操作在多样本并行处理时,显著提升了效率和一致性。

PCR 扩增与批量一致性控制

PCR 扩增是高通量 NGS 建库的最后关键步骤之一,对加样顺序和反应条件一致性要求较高。Opentrons Flex 能在扩增前完成 PCR 体系的自动配置,确保各孔反应组分比例一致,为后续扩增提供稳定条件。

在高通量实验中,这种自动化配置有助于减少扩增偏倚,提高文库数据的可比性。

自动抓手提升整体流程连贯性

高通量 NGS 建库涉及多块板之间的频繁切换。Opentrons Flex 的自动抓手功能可在协议中完成板位转移,减少人工干预。这种连贯式操作不仅提升效率,也降低了因人工操作带来的污染风险。

总结

高通量 NGS 建库流程涉及多个对精度和一致性要求极高的关键步骤。Opentrons Flex 通过精准移液、模块化硬件支持、自动化磁珠处理以及流程连贯控制,为高通量建库提供了稳定可靠的自动化基础。对于需要长期开展多样本 NGS 项目的实验室而言,这种支持不仅提升了效率,也为数据质量的稳定输出提供了有力保障。

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